В 2014 году избран главным ученым секретарем РААСН. Является автором и соавтором более 800 научных работ
В 2016 году присвоено звание профессора по научной специальности «Математическое моделирование, численные методы и комплексы программ»
С 2020 года занимает должность ректора НИУ МГСУ
В 2022 году провел несколько структурных преобразований в МГСУ, направленных на увеличение востребованности выпускников и взаимодействия с отраслью. В этой области университету помогают Минстрой России, московские департаменты и организации. Также в 2021-2022 годах особое внимание было уделено совершенствованию программ обучения, которое направлено в том числе и на изучение цифровых технологий в архитектуре и строительстве.
Параллельно с руководством университета занимается научно-исследовательской работой, которая связана с разработкой, исследованием и развитием численных и численно-аналитических методов многоуровневого расчета строительных конструкций. По этой же теме еще в 2000 году защитил кандидатскую и в 2005 докторскую диссертацию. Кроме того, являлся профессором ряда технических университетов: ТГАСУ, РУДН, СамГТУ. Писал научные статьи для нескольких журналов, в которых также занимал должность редактора.
Павел Акимов стал обладателем различных наград за свою научную деятельность, среди которых: Гранты Президента РФ, Гранты РААСН, Почетная медаль МГСУ «За заслуги в строительном образовании и науке», Почетная грамота Министерства регионального развития Российской Федерации.